教育部小学校长培训中心成立于2000年，是教育部直属和重点建设的四个国家级培训中心之一，承担教育部“领航工程基地”培养任务，是全国职后校长人才培养和培训的重要基地。中心秉承“卓越、仁爱、和谐、有为”的理念，以“做教育培训的引领者”为目标，为我国教育事业的改革与发展做出了卓越贡献。

20年以来，中心承办培训班次245个，培训学员14000余人次。中心积极开展中小学校长、幼儿园园长、培训者、特殊学校校长以及港澳台校长的培养培训。其中，国家级培训项目包括：“国培计划”——中小学名校长领航项目、“国培计划”——全国小学优秀校长高级研究项目、“国培计划”——全国小学骨干校长高级研修项目、“校长国培计划”——边远贫困地区农村校长助力工程项目等。

自2010年起，中心承办教育部送培进西藏、新疆和青海项目。为贯彻落实中共中央、国务院关于打赢脱贫攻坚战的决策部署，加大对“三区三州”地区中小学、幼儿园校（园）长队伍建设的支持力度，中心于2019年承办教育部送培进南疆地区国家级专项培训项目、2020年承办教育部送培进怒江州和凉山州国家级专项培训项目。

中心积极推进培训国际化，先后与美国、加拿大、芬兰、英国、德国、法国、澳大利亚、日本、新加坡等国家的教育培训机构建立了合作关系，并与港澳台教育机构开展合作，聘请国外及港澳台著名专家学者授课讲学，积极探索国际及港澳台合作的新模式。